QFoldAgent: Sistema Quantistico Multi-Agente Autonomo per il Ripiegamento Proteico
Un nuovo framework chiamato QFoldAgent utilizza un sistema multi-agente a ciclo chiuso per la predizione ibrida quantistico-classica della struttura proteica su reticoli tetraedrici a 5 residui. Un agente di progettazione propone pesi di penalità hamiltoniani condizionati dalla sequenza, una pipeline basata su VQE ottimizza sotto il rumore di Qiskit Aer, e un agente di feedback perfeziona le penalità utilizzando diagnostiche del paesaggio energetico e la validazione MolProbity. L'RMSD rispetto alla struttura reale non è rivelato agli agenti. Testato su 55 frammenti di QDockBank e 100 sequenze non viste, QFoldAgent ha ridotto l'RMSD mediano da 3.64 Å sul benchmark.
Fatti principali
- QFoldAgent è un framework multi-agente per la predizione della struttura proteica.
- Utilizza un agente di progettazione, una pipeline quantistico-classica basata su VQE e un agente di feedback.
- Il sistema opera su reticoli tetraedrici a 5 residui.
- I pesi di penalità hamiltoniani sono adattati per ogni sequenza.
- L'ottimizzazione utilizza il modello di rumore di Qiskit Aer.
- Il feedback si basa su diagnostiche del paesaggio energetico e MolProbity.
- L'RMSD è usato solo per la valutazione, non è esposto agli agenti.
- Testato su 55 frammenti di QDockBank e 100 sequenze non viste.
- L'RMSD mediano è stato ridotto da 3.64 Å sul benchmark QDockBank.
Entità
Istituzioni
- arXiv
- Qiskit Aer
- MolProbity
- QDockBank