Nuovo framework MCTH basato solo su inferenza mira a unificare il co-design di sequenza-struttura biomolecolare

Un recente preprint su arXiv (2608.17381) presenta MCTH (Monte Carlo Tree Hallucination), un sistema basato solo su inferenza che riformula il co-design di sequenza-struttura a tutti gli atomi come pianificazione che tiene conto dell'incertezza sugli stati immaginati derivati da modelli preaddestrati di folding e inverse folding. MCTH considera questi modelli come operatori a scatola nera immutabili e impiega la ricerca ad albero Monte Carlo per distribuire un budget di inferenza prestabilito tra vari percorsi di progettazione, tenendo conto della confidenza del modello, dell'incertezza e del consenso o disaccordo di più predittori. Questo metodo si concentra sulla progettazione di nuove interazioni, in particolare per DNA/RNA e altre modalità non proteiche meno studiate, che affrontano limitazioni geometriche e chimiche più severe a causa della mancanza di dati complessi estesi. Sebbene la progettazione biomolecolare sia fondamentale per il riconoscimento molecolare, la terapeutica e la biologia sintetica, rimane una sfida complessa. MCTH può anche integrare il controllo biofisico all'interno dello stesso processo decisionale, fornendo un approccio coeso alla progettazione generativa. Il paper è stato classificato come cross-type su arXiv.