MolBioKG: Ancorare Molecole Fuori Grafico in Grafi di Conoscenza Biomedici

MolBioKG è un sistema all'avanguardia progettato per risolvere il problema del cold-start affrontato dalle molecole non registrate nei grafi di conoscenza biomedici (KG). A differenza degli approcci tipici che assumono che le molecole interrogate siano già nel grafo, MolBioKG collega con successo queste molecole non viste. Ciò viene ottenuto tramite ancoraggio strutturale multi-risoluzione, collegandosi a un KG che include 9,6 milioni di archi e 2,74 milioni di molecole indicizzate, rappresentate come scaffold, frammenti, gruppi funzionali e impronte digitali. Il sistema può recuperare entità grafiche correlate da una stringa SMILES ed esplorare i loro contesti biomedici senza necessitare di addestramento specifico. Utilizza due metodi di inferenza: recupero statico multi-ancora con Reciprocal Rank Fusion e Adapt-KG, che è una politica LLM che usa strumenti per la traversata dinamica. Le valutazioni mostrano prestazioni migliorate su vari compiti. La ricerca è disponibile su arXiv con identificatore 2608.06713.