LLMBDC: Framework LLM Zero-Shot per il Clustering Context-Aware dei Termini GO

LLMBDC è un nuovo framework senza addestramento progettato per il clustering dei termini della Gene Ontology (GO). Questo approccio innovativo sfrutta il ragionamento semantico zero-shot insieme al punteggio di confidenza per raggruppare i termini GO in BioDomains utilizzando solo dati ontologici. A differenza degli strumenti esistenti come REVIGO, GOSemSim e clusterProfiler::simplify(), che si basano su metriche di similarità fisse, o Metascape, che impiega misure di sovrapposizione genica, LLMBDC offre una soluzione più dinamica. Inoltre, supera i limiti delle mappature gerarchiche statiche di GO-slim e la soggettività della cura manuale. Lo studio completo è disponibile su arXiv con l'identificatore 2608.00099.