CoRe-Gen: Generazione Robusta da Spettro a Struttura in Condizioni di Impronte Digitali Imperfette

CoRe-Gen, una tecnica innovativa, affronta la difficoltà di determinare le strutture molecolari da spettri di massa tandem (MS/MS) per la generazione de novo che supera i limiti dei database. Questo metodo suddivide il processo in due fasi: prevedere le impronte digitali dagli spettri e poi decodificare le strutture da tali impronte, utilizzando ampi set di dati molecolari. Tuttavia, la sua implementazione dipende da impronte digitali previste anziché ideali, portando a errori strutturati che possono influenzare la generazione. Per migliorare le condizioni intermedie, CoRe-Gen impiega un pre-addestramento su spettri sintetici per l'encoder, affronta il rumore legato all'implementazione con una corruzione delle impronte digitali sensibile alla frequenza durante l'addestramento del decoder e riduce gli errori residui attraverso strategie sensibili alla struttura.