bioMoR: Mixture-of-Recursions guidata dalla biologia per l'apprendimento genomico
bioMoR è un nuovo framework che applica Mixture-of-Recursions (MoR) all'apprendimento a livello di geni e di percorsi biologici nella genomica. È il primo a integrare conoscenze biologiche strutturate in un backbone MoR, identificando tre punti chiave: condivisione di informazioni basata su grafi per affinare gli embedding dei token, un bias strutturale per guidare l'auto-attenzione verso token biologicamente correlati, e un router consapevole del grafo che utilizza informazioni di vicinato per determinare la profondità di ricorsione. Il framework mira a migliorare l'efficienza nell'analisi omica ad alta dimensionalità instradando adattivamente i token, poiché solo un sottoinsieme di geni o percorsi richiede calcolo profondo. L'articolo è disponibile su arXiv con identificativo 2608.06727.
Fatti principali
- bioMoR applica Mixture-of-Recursions all'apprendimento a livello di geni e di percorsi biologici.
- È il primo framework ad applicare MoR alla genomica.
- Sono identificati tre punti di integrazione per la conoscenza biologica.
- La condivisione di informazioni basata su grafi affina gli embedding dei token.
- Il bias strutturale guida l'auto-attenzione verso token biologicamente correlati.
- Il router consapevole del grafo utilizza informazioni di vicinato per la profondità di ricorsione.
- L'articolo è disponibile su arXiv con ID 2608.06727.
- Il framework è destinato all'analisi omica ad alta dimensionalità.
Entità
Istituzioni
- arXiv